Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHPF2Q9P2E5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms