Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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