Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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