Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms