Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GIN1Q9NXP7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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