Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms