Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN4Q9NQP4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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