Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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