Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms