Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNS3Q9BQ31 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms