Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms