Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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