Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms