Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms