Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL1Q92935 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms