Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4CQ8WTT0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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