Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms