Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms