Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD7Q6ZUT3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms