Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC27A4Q6P1M0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms