Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms