Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms