Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms