Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms