Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNIP1Q15025 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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