Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGRF1Q13972 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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