Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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