Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB2AQ13885 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TUBB2AQ13885 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TUBB2AQ13885 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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TUBB2AQ13885 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TUBB2AQ13885 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TUBB2AQ13885 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TUBB2AQ13885 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB2AQ13885 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB2AQ13885 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB2AQ13885 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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