Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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