Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms