Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNH2Q12809 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNH2Q12809 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms