Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TYRO3Q06418 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms