Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms