Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms