Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms