Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms