Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HBBP68871 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HBBP68871 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms