Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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