Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms