Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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