Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms