Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAF6P49848 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAF6P49848 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms