Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms