Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSFMP43897 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSFMP43897 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms