Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP2P42575 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms