Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIPAP38571 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms