Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms