Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BMI1P35226 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms