Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms