Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms